Zgodnie ze specyfikacją, do GEMS eksportowane są tylko wybrane kategorie produktów. Narzędzie, które służy do przypisania poszczególnych produktów do odpowiednich kategorii GEMS znajduje się w Produktach -> Lista produktów.
Aby skonfigurować kategorie GEMS należy w prawym górnym rogu, w polu Desktop, wybrać: GEMS Desktop, a następnie każdy produkt, który ma być eksportowany do GEMS przypisać do odpowiedniej kategorii. Uwaga: konfigurację należy wykonać tylko dla głównych produktów w pakietach (nie należy konfigurować kategorii dla opłat za pośrednictwo). Wyboru dokonuje się zozwijając listę dostępnych kategorii, klikając na właściwą, a następnie klikając na zielony klawisz Plus z lewej strony wybranej kategorii.